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                InsideHPC特殊陈诉:基因组学期间的HPC和AI(一)

                2020-06-08 22:02泉源:中国存储网
                导读:在《 HPC特殊陈诉:基因组学期间的HPC和AI》中,偏重引见了由戴尔科技创立的Ready Solutions系列,这些处理方案颠末高度优化和调解,可用于种种行业。

                由戴尔科技资助的这份特殊陈诉深化讨论了基因组学期间的生命迷信HPC和AI。新型冠状病毒或COVID-19的迸发将留念2020年。虽然熏染率呈指数级增长,但寻觅医治,疫苗或治愈办法的比赛仍在持续。当局和公家构造正在通力进行,理解该病毒的根本生物学,其遗传暗码,以找到可以制止该病毒的办法。

                针对此题目,少量的盘算才能都针对此题目,包罗运用当当代界上最弱小的高功能盘算(HPC)零碎。找到治愈或消弭COVID-19的办法不只会使全天下的生齿受害,并且还将成为应对下一次大盛行的根底,一些迷信家称这种盛行将在不久的未来发作。

                这份技能指南,在《 HPC特殊陈诉:基因组学期间的HPC和AI》中,偏重引见了由Dell Technologies创立的Ready Solutions系列,这些处理方案颠末高度优化和调解,可用于种种行业。HPC Life Sciences的Ready处理方案旨在延长消费工夫,经过专门设计的处理方案进步功能,并经过模块化的构建模块来扩展容量和功能,从而更轻松地扩展范围。

                引见

                新型冠状病毒或COVID-19的迸发将留念2020年。虽然熏染率呈指数级增长,但寻觅医治,疫苗或治愈办法的比赛仍在持续。当局和公家构造正在通力进行,理解该病毒的根本生物学,其遗传暗码,以找到可以制止该病毒的办法。针对此题目,少量的盘算才能都针对此题目,包罗运用当当代界上功用最弱小的高功能盘算(HPC)零碎。[1] 找到治愈或消弭COVID-19的办法不只会使全天下的生齿受害,并且还将成为应对下一次大盛行的根底,一些迷信家说,这一大盛行将在不久的未来发作。[2]

                人工智能(AI)

                阿斯利康基因组研讨中央(CGR)的基因组剖析和信息学担任人SlavéPetrovski表明说,人工智能在该范畴具有普遍的用处。他说,组成人类基因组的约莫30亿个碱基对可以经过AI停止剖析,以找到遗传变异。下一步是确定置入差别数据的相信度,以决议其能否代表生物学遗传变异。

                AI正在与传统的HPC仿原形联合,以预测更精确的后果。基于先前完成的盘算,算法可以确定下一个输出或后果能够是什么。比方,假如卵白A表现出杀去世冠状病毒的亲和力,那么卵白B(或其他卵白)能否有更好的时机或更无效?

                基因组学研讨中有很多AI用处可以辨认并促进药物靶标互相作用。经过将剖析和主动化进程与正在停止的基因组学研讨相联合,对这一范畴的更片面的理解将会获得停顿。人工智能可以招致人们对数据的形式和非常有更深化的理解,而人类一开端能够看不到这些相干性。经过运用呆板和深度学习技能,新的更无效的药物可以更快地送给患者,并将更好地针对疾病。

                研讨公司Produvia曾经确定了AI将从中受害的五个范畴:

                1. 提取临床适用的基因组和表观基因组变体
                2. 判定基因
                3. 预测基因组联系关系
                4. 预测卵白质功用,以及
                5. 预测序列DNA和RNA联合卵白的特异性。

                精细医学

                固然AI可以使基因组研讨受害,但终极目的是创立专门针对熏染或疾病遗传暗码的医治办法,并针对团体的基因构成量身定制医治办法。为此,需求少量的数据,盘算才能以及将很多专业知知趣联合的协作。

                经过将更快,更精确的基因组测序与更快的盘算机零碎和新算法相联合,发明哪种药物对集体病原体和患者最无效的发明办法曾经从研讨机构转移到了床边大夫。如今,外科大夫和其他医疗保健提供者拥有更好,更快,更精确的东西和数据,可以依据更少数据确定最佳医治方案。关于小儿癌症患者尤其云云。

                特性化或精细医学是在团体层面上办理疾病的创新办法的要害。基于遗传或细胞信息的知识,定制关于针对每个病原体和/或集体的保健办理的种种决议。可以为每团体量身定制疾病的诊断办法和医治办法。但是,随着该迷信范畴的开展,存在很多应战,比方羁系,知识产权和患者隐私。

                活着界范畴内,很多国度/地域都在投入资源和精神以更多地理解基因组学以及怎样将这些知识使用于特性化医学。图1表现了全天下为需求的人提供精细医学的高兴。图2表现理解码人类基因组的本钱是怎样低落的,乃至比摩尔定律还要快。

                InsideHPC特殊陈诉:基因组学期间的HPC和AI(一)

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                要害词 :
                HPC AI
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